Наполнив аквариум водой и посадив растения, спустя два-три дня владелец замечает, что вода мутнеет. Это происходит из-за развития огромного количества бактерий. Через пару дней они погибнут, так как «съедят» все питательные вещества, имеющиеся в воде, и аквариум сделается кристально чистым. Такой процесс называется установлением начального биологического режима. При оптимальном биологическом режиме вода абсолютно прозрачна и имеет еле уловимый запах свежескошенной травы или водорослей. Уход за аквариумом направлен на поддержание этого состояния и заключается в правильном кормлении обитателей, периодической чистке водоёма и регулярной подмене воды. Минимальная подмена воды, примерно 25 % объёма в месяц, необходима даже при самых совершенных системах фильтрации и стерилизации. Во время акклиматизации рыбы нуждаются в более частой подмене воды (еженедельно или даже ежедневно) и в больших объёмах — до 90 %.
Конечно, воду надо специально подготовить, т. е. в первую очередь освободить от хлора. Её температура и показатель рН должны быть такими же, как в аквариуме. Обрастание стенок аквариума зелёными водорослями обычно указывает на благоприятный режим, и по этому поводу владельцу не стоит беспокоиться. Стекло очищают лезвием бритвы. Для оргстекла больше подходит грубая капроновая ткань, которая не царапает пластик. Магнитные очистители с пластмассовой щёткой пригодны для аквариумов обоих типов.
Остатки водорослей, экскременты рыб и улиток убирают со дна, высасывая их вместе с водой резиновым или пластиковым шлангом. Затем, чтобы довести уровень жидкости до нормы доливают обычную водопроводную воду (но не более 5-10 % за раз). При генеральной уборке, когда откачиваемый объём слишком велик, для очистки водопроводной воды применяют препараты типа «Хлор-минус» или предварительно отстаивают её.
